Dissimilarity NWA Algorithm

程式執行時，所拜訪過的程式碼片段，組合而成一個序列，稱之為執行序列(Execution Sequence)。不同執行序列間因可能執行過共同的程式碼片段，而存在著關聯性。執行序列常於測試案例選擇的研究中被探討，類似生物資訊領域中計算序列相似度時，利用一些常見的距離(Distance)或相似度(Similarity)計算公式，探討序列間彼此的差異以提供分類或是選擇的依據。以往執行序列的距離及相似度計算公式，在物件導向的程式執行序列中，並無法分辨出多型(polymorphism)這樣的特性。因此本研究利用生物資訊領域中計算序列相似度的演算法Needleman – Wunsch Algorithm ( NWA )，納入執行序列發生多型行為及程式執行順序等特性為考量，提出計算出執行序列間差異度(Dissimilarity)的方法，以解決目前探討執行序列相似度所存在之問題。

Download

原始碼託管於oolab's gitlab，使用git指令下載 (請確認擁有該repository權限)

git@140.115.53.53:oolab/dissimilarity.git

Installation

Dissimilarity專案為Visual Studio 2012，下載原始碼後可以直接透過點擊sln開啟專案。

Program structure

Dissimilarity屬於小型專案，程式碼大約300多行。主體架構分為兩個檔案

• Program.cs - 程式主體，負責讀檔與輸出結果
• NeedlemanWunsch.cs - NWA演算法核心

Tutorial

Dissimilarity主要讀取專案目錄底下 Execution Sequence/ 資料夾，預先放置好trace case。

預設trace case範例以放置於Dissimilarity目錄底下。

本專案不須經由任何設定。啟動Visual Studio開啟本專案直接執行後，即可得到dissimilarity結果。

最後Dissimilarity會在console輸出結果，並一同將結果存於Execution Sequence result.txt。

Improvements and Problems

None