20121220 Ryan

Progress

• Done
  • PTA
    • fixed the editing problem
    • fix bugs and release
  • Research
    • make sure NWA is a good choice
    • have more specific idea of Distance
• In progress
  • PTA
    • path config problem
  • Research
    • coverage and similarity 是否為互補關係
    • 為何因為多型 sequence 會比較近?
    • loop 的問題不好解，但是可以進行假設，該如何做
    • 可以把smoke test這個term放到投影片中
    • 我的distance 概念跟 similarity的概念有甚麼不同
    • Jaccard Index 在 polymophism 上會不會比NWA好